作为近代实验科学的始祖，我们可以想象，他所要建立的教育学绝不是以往的形而上学的思辩的教育学，而是“科学”的教育学。他的目的被日后教育学的发展所实现。
到了夸美纽斯，教育学便明确了对科学性的追求。1632年出版的《大教学沦》显露出对科学的痴心。正如《大教学论》开篇即阐明的，夸美纽斯的重点，在于教学方法的探讨——它要阐明把一切事物教给一切人类的全部艺术。那么，依据什么来确立教学方法即解决“怎样教”的问题呢?他认为，只有依据“自然秩序”。在他看来，人是自然的一部分，服从自然的普遗法则；教育的原理只有在与“自然原理”一致时，才是可靠的。这就是教育史上著名的“自然适应姓原理”。他深受培根经验论的影响，以知识的获得过程来说明教学过程。在《大教学论》第二十章，他集中论述了“科学教学法”。
何谓“科学”?他认为科学就是关于自然的知识；这种知识的获得有三个部分：一是被观察的物件；二是光亮，即必须的注意；三是内知觉的眼睛，即心灵的悟性。由此他提出科学的教学法必须包括如下三步：
第一步，将事物呈现在学生面前；“在可能范围内，一切事物都应该尽量地放到感官面前。”
第二步．激发学生注意：“有了注意……才能了解放在眼前的一切事物。”
第三步．依据视觉程序，安排事物呈现的方式，“它们可以用九条极有用的规则表示出来”。
